{"id":148450,"date":"2020-06-03T10:17:29","date_gmt":"2020-06-03T12:17:29","guid":{"rendered":"https:\/\/lab.fabricadelandings.com.br\/portalsaofrancisconovo\/?p=148450"},"modified":"2020-06-03T10:17:29","modified_gmt":"2020-06-03T12:17:29","slug":"dinamica-molecular","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/lab.fabricadelandings.com.br\/portalsaofrancisconovo\/ciencias-da-natureza\/fisica\/dinamica-molecular","title":{"rendered":"Din\u00e2mica molecular"},"content":{"rendered":"

Defini\u00e7\u00e3o<\/strong><\/p>\n

A\u00a0din\u00e2mica molecular<\/strong>\u00a0\u00e9 um m\u00e9todo que usa as equa\u00e7\u00f5es de movimento de Newton para simular computacionalmente a evolu\u00e7\u00e3o do tempo de um conjunto de \u00e1tomos em intera\u00e7\u00e3o.<\/p>\n

Tais t\u00e9cnicas dependem de uma descri\u00e7\u00e3o de como as mol\u00e9culas ir\u00e3o interagir – um campo de for\u00e7a – e s\u00e3o populares na qu\u00edmica de materiais, bioqu\u00edmica e biof\u00edsica.<\/p>\n

A\u00a0din\u00e2mica molecular\u00a0\u00e9 uma t\u00e9cnica para simula\u00e7\u00e3o computacional de sistemas complexos, modelados no n\u00edvel at\u00f4mico.<\/p>\n

As equa\u00e7\u00f5es de movimento s\u00e3o resolvidas numericamente para acompanhar a evolu\u00e7\u00e3o no tempo do sistema, permitindo a deriva\u00e7\u00e3o de propriedades cin\u00e9ticas e termodin\u00e2micas de interesse por meio de ‘experimentos em computador’.<\/p>\n

Macromol\u00e9culas biologicamente importantes e seus ambientes s\u00e3o rotineiramente estudados usando\u00a0simula\u00e7\u00f5es de din\u00e2mica molecular.<\/p>\n

O que \u00e9 din\u00e2mica molecular?<\/strong><\/p>\n

Din\u00e2mica molecular\u00a0\u00e9 o estudo da maneira como \u00e1tomos e mol\u00e9culas se movem.<\/p>\n

A observa\u00e7\u00e3o direta dessas part\u00edculas nem sempre \u00e9 poss\u00edvel; portanto, os cientistas estudam a din\u00e2mica molecular usando f\u00f3rmulas matem\u00e1ticas.<\/p>\n

Essas f\u00f3rmulas s\u00e3o programadas em computadores que permitem aos cientistas simular o movimento de v\u00e1rios \u00e1tomos e mol\u00e9culas.<\/p>\n

Embora part\u00edculas reais n\u00e3o sejam usadas no estudo da din\u00e2mica molecular. Os resultados das simula\u00e7\u00f5es s\u00e3o considerados razoavelmente precisos.<\/p>\n

O estudo da\u00a0din\u00e2mica molecular\u00a0\u00e9 um tipo de experimento virtual. Ao estudar o comportamento das mol\u00e9culas virtuais, os cientistas podem fazer previs\u00f5es sobre como as mol\u00e9culas reais podem se comportar.<\/p>\n

Embora nenhuma mol\u00e9cula real seja usada, os resultados dessas experi\u00eancias simuladas s\u00e3o considerados precisos. Ajustar certos par\u00e2metros nas equa\u00e7\u00f5es torna os experimentos mais precisos.<\/p>\n

Simula\u00e7\u00f5es da din\u00e2mica molecular s\u00e3o usadas para fazer observa\u00e7\u00f5es virtuais do movimento de part\u00edculas. Em um laborat\u00f3rio, nem sempre \u00e9 poss\u00edvel ou pr\u00e1tico fazer observa\u00e7\u00f5es reais do movimento molecular; portanto, a simula\u00e7\u00e3o matem\u00e1tica e a modelagem por computador s\u00e3o usadas.<\/p>\n

Os benef\u00edcios desses tipos de experimentos s\u00e3o que o movimento pode ser observado por um longo per\u00edodo de tempo, que pode ser observado de perto e que condi\u00e7\u00f5es, como extremos de press\u00e3o ou temperatura que n\u00e3o s\u00e3o pr\u00e1ticas no laborat\u00f3rio, podem ser observadas simuladas.<\/p>\n

Os computadores s\u00e3o capazes de exibir uma representa\u00e7\u00e3o visual do movimento de \u00e1tomos e mol\u00e9culas, resolvendo equa\u00e7\u00f5es matem\u00e1ticas.<\/p>\n

As equa\u00e7\u00f5es s\u00e3o baseadas nas leis de Newton e podem prever com precis\u00e3o o movimento da maioria dos \u00e1tomos e mol\u00e9culas.<\/p>\n

Os programas de simula\u00e7\u00e3o usam as equa\u00e7\u00f5es para representar as for\u00e7as que atuam nas part\u00edculas e o movimento dos \u00e1tomos no espa\u00e7o tridimensional.<\/p>\n

Tamb\u00e9m \u00e9 poss\u00edvel rastrear o movimento de um \u00e1tomo ou mol\u00e9cula ao longo do tempo usando essas f\u00f3rmulas.<\/p>\n

A din\u00e2mica molecular tamb\u00e9m pode ser usada para observar as rela\u00e7\u00f5es entre \u00e1tomos e mol\u00e9culas.<\/p>\n

Os programas de simula\u00e7\u00e3o rastreiam as liga\u00e7\u00f5es moleculares formadas e quebradas e ajustam as equa\u00e7\u00f5es de acordo. Embora as equa\u00e7\u00f5es usadas sejam baseadas nas leis do movimento de Newton, na maioria dos casos elas podem ser aplicadas ao movimento de part\u00edculas muito pequenas.<\/p>\n

Ocasionalmente, as leis que governam o movimento de part\u00edculas qu\u00e2nticas devem ser usadas nas equa\u00e7\u00f5es da din\u00e2mica molecular para descrever corretamente o movimento das part\u00edculas.<\/p>\n

Din\u00e2mica molecular – Simula\u00e7\u00f5es<\/strong><\/p>\n

As\u00a0simula\u00e7\u00f5es de din\u00e2mica molecular\u00a0evolu\u00edram para uma t\u00e9cnica madura que pode ser usada efetivamente para entender as rela\u00e7\u00f5es estrutura-fun\u00e7\u00e3o-macromoleculares.<\/p>\n

Os tempos de simula\u00e7\u00e3o atuais s\u00e3o pr\u00f3ximos dos biologicamente relevantes.<\/p>\n

As informa\u00e7\u00f5es coletadas sobre as propriedades din\u00e2micas das macromol\u00e9culas s\u00e3o ricas o suficiente para mudar o paradigma usual da bioinform\u00e1tica estrutural, estudando estruturas \u00fanicas para analisar conjuntos conformacionais.<\/p>\n

Simula\u00e7\u00f5es de din\u00e2mica molecular\u00a0s\u00e3o ferramentas importantes para entender a base f\u00edsica da estrutura e fun\u00e7\u00e3o das macromol\u00e9culas biol\u00f3gicas.<\/p>\n

A vis\u00e3o inicial das prote\u00ednas como estruturas relativamente r\u00edgidas foi substitu\u00edda por um modelo din\u00e2mico no qual os movimentos internos e as altera\u00e7\u00f5es conformacionais resultantes desempenham um papel essencial em sua fun\u00e7\u00e3o.<\/p>\n

Esta revis\u00e3o apresenta uma breve descri\u00e7\u00e3o da origem e usos iniciais de simula\u00e7\u00f5es biomoleculares.<\/p>\n

Em seguida, descreve alguns estudos recentes que ilustram a utilidade de tais simula\u00e7\u00f5es e termina com uma discuss\u00e3o sobre seu potencial cada vez maior de contribuir para a biologia.<\/p>\n

\"Din\u00e2mica
\nDin\u00e2mica molecular<\/strong><\/p>\n

\"Din\u00e2mica
\nSimula\u00e7\u00e3o de din\u00e2mica molecular da propaga\u00e7\u00e3o de \u00edons atrav\u00e9s de um canal de prote\u00ednas<\/strong><\/p>\n

Fonte:<\/strong>\u00a0embnet.vital-it.ch\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/www.nature.com\/dasher.wustl.edu\/www.wisegeek.org\/web.stanford.edu\/www.fz-juelich.de\/www.frontiersin.org<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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